Моделирование деления биологических клеток в стадии метафазы на суперкомпьютере "Ломоносов-2"
Кривов М.А., Зайцев А.В., Атауллаханов Ф.И., Иванов П.С.

Статья посвящена проблеме построения математической модели биологической клетки, описывающей процесс ее деления в рамках M-фазы. Рассмотрено предложенное авторами уточнение одной из известных моделей путем перехода с двумерного на трехмерный случай. Модифицированная модель реализована в виде универсального программного комплекса для моделирования деления клеток в стадиях прометафазы, метафазы и анафазы на локальных машинах и суперкомпьютерах. С его помощью на кластере "Ломоносов-2" изучено влияние размера активной области кинетохора на количество меротельных зацеплений в стадии метафазы. Показано, что наблюдаемая зависимость проявляется не столько из-за геометрических ограничений, как предполагалось ранее, сколько из-за больших углов разворота пар хромосом.

Ключевые слова: митоз, метафаза, кинетохор, меротельные микротрубочки, математическое моделирование, суперкомпьютер.

Название статьи, аннотация и ключевые слова на английском языке

  • Кривов М.А. – Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, факультет вычислительной математики и кибернетики, Ленинские горы, 119991, Москва; математик, e-mail: m_krivov@cs.msu.su
  • Зайцев А.В. – Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН, ул. Косыгина, 4, 119991, Москва; cт. науч. сотр., e-mail: zaytsev.anatoly@gmail.com
  • Атауллаханов Ф.И. – Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН, ул. Косыгина, 4, 119991, Москва; директор, e-mail: ataullakhanov.fazly@gmail.com
  • Иванов П.С. – Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, физический факультет, Ленинские горы, 119991, Москва; cт. науч. сотр., e-mail: psmart@rambler.ru